Компьютеры самопроизвольно не перегружаються , а тем более w2k3...
Если не збой в электропитании , то должна быть какая то причина, и она с болшьшой степенью вероятности должна была бы попасть в логи системы...
Да бывают и не такие ещё...Судя по симптоматике была повреждена таблица разделов...А способных на такое зверушек полным-полно...
Может быть и такое,если это так ,то как то это странно...Недальновидно с его стороны...Обычно такие люди стараються не привлекать внимания админов,а делать свои дела по тихому, тише едешь-дальше будешь ))

FMD, Те диски что лишились разделов в момент перезагрузки писали данные на них. В логах должен отразится модуль/либа которая заглючила и пустила машину в перезагрузку.
Модуль или либа может быть любой у меня так модуль от IE6 какой-то о котором я и знать не знал и он никаких очень полезных действий не делал оставил один диск без таблицы разделов вот такой же перезагрузкой. По логам он сглючил и выдал BSOD с последующим ребутом. Так что прямой связи может и не быть.

Копайте логи и там большая часть ответа.
И вообще рекомендуемая конфигурация сервера которая спасала данные не раз - 2 диска в RAID1 под систему ТОЛЬКО и остальные (если больше 2-х) в RAID5. Сервак с ИБП и настроенным режимом выключения при отрубании питания.
Если AD то не меньше чем 2 сервака в связке на домен.