Конкретно по вопросу - если существует возможность связи по типу клиент-сервер, либо возможность backconnect'a.

Скорее всего лично у меня создаётся впечатление, что вы имеете ввиду:

"Как выполнить эксплоит на сервере через шелл".

Если это так, то собственно проверив установленные модули (mod_perl, php) - так же как вы бы это делали из консоли. Эксплоиты на альтернативных языках компилируются либо предварительно, либо на шелле с  использованием собранного компилятора.

тоесть )

скорее всего стоит воспользоваться услугами интерпретатора и набрать там соответствующие вещи для запуска PHP/PERL скриптов (php скрипт, perl скрипт). Как же ты собрался эксплоит запускать не зная его языка и способа исполнения ?)